MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_10

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011771	A	11	11	398	408	100 %	0 %	0 %	0 %	218847804
2	NC_011771	CTT	2	6	460	465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847804
3	NC_011771	T	7	7	464	470	0 %	100 %	0 %	0 %	218847804
4	NC_011771	TTC	2	6	477	482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847804
5	NC_011771	TGT	2	6	517	522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847804
6	NC_011771	ACA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847804
7	NC_011771	ATA	2	6	559	564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847804
8	NC_011771	AC	3	6	594	599	50 %	0 %	0 %	50 %	218847804
9	NC_011771	TCT	2	6	607	612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847804
10	NC_011771	GTT	2	6	613	618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847804
11	NC_011771	T	7	7	648	654	0 %	100 %	0 %	0 %	218847804
12	NC_011771	TAAA	2	8	791	798	75 %	25 %	0 %	0 %	218847804
13	NC_011771	A	6	6	796	801	100 %	0 %	0 %	0 %	218847804
14	NC_011771	CTT	3	9	803	811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847804
15	NC_011771	TAC	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847804
16	NC_011771	AAT	2	6	839	844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847804
17	NC_011771	ATT	2	6	856	861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847804
18	NC_011771	AAC	2	6	1200	1205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847798
19	NC_011771	TTCC	2	8	1211	1218	0 %	50 %	0 %	50 %	218847798
20	NC_011771	T	7	7	1257	1263	0 %	100 %	0 %	0 %	218847798
21	NC_011771	TTC	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847798
22	NC_011771	ATTT	2	8	1287	1294	25 %	75 %	0 %	0 %	218847798
23	NC_011771	CTT	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847798
24	NC_011771	ATC	2	6	1458	1463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847798
25	NC_011771	TGA	2	6	1530	1535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847798
26	NC_011771	TCTAA	2	10	1606	1615	40 %	40 %	0 %	20 %	218847798
27	NC_011771	ATG	2	6	1949	1954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847807
28	NC_011771	TAAAT	2	10	1967	1976	60 %	40 %	0 %	0 %	218847807
29	NC_011771	AAT	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847807
30	NC_011771	AAT	2	6	2042	2047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847807
31	NC_011771	TAG	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847807
32	NC_011771	ATAA	2	8	2073	2080	75 %	25 %	0 %	0 %	218847807
33	NC_011771	AAT	2	6	2108	2113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847807
34	NC_011771	ATTT	2	8	2398	2405	25 %	75 %	0 %	0 %	218847802
35	NC_011771	GAC	2	6	2414	2419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218847802
36	NC_011771	GCT	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218847802
37	NC_011771	TTC	2	6	2511	2516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847802
38	NC_011771	TTA	2	6	2519	2524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847802
39	NC_011771	TTG	2	6	2559	2564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847802
40	NC_011771	AATT	2	8	2577	2584	50 %	50 %	0 %	0 %	218847802
41	NC_011771	ATA	2	6	2621	2626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847802
42	NC_011771	TAT	2	6	2628	2633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847802
43	NC_011771	CTA	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847802
44	NC_011771	TTC	2	6	2731	2736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847802
45	NC_011771	A	6	6	2786	2791	100 %	0 %	0 %	0 %	218847802
46	NC_011771	ATT	2	6	2799	2804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847802
47	NC_011771	TCC	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218847802
48	NC_011771	TAA	2	6	3103	3108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847799
49	NC_011771	TCT	2	6	3139	3144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847799
50	NC_011771	ATGA	2	8	3188	3195	50 %	25 %	25 %	0 %	218847799
51	NC_011771	GGA	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218847799
52	NC_011771	AT	3	6	3207	3212	50 %	50 %	0 %	0 %	218847799
53	NC_011771	ATT	2	6	3277	3282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847799
54	NC_011771	ATC	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847799
55	NC_011771	TAT	2	6	3479	3484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847799
56	NC_011771	TTTGC	2	10	3485	3494	0 %	60 %	20 %	20 %	218847799
57	NC_011771	AAC	2	6	3510	3515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847799
58	NC_011771	A	7	7	3573	3579	100 %	0 %	0 %	0 %	218847799
59	NC_011771	ATTGGT	2	12	3649	3660	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218847799
60	NC_011771	TACCAA	2	12	4284	4295	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218847800
61	NC_011771	GATTT	2	10	4359	4368	20 %	60 %	20 %	0 %	218847800
62	NC_011771	T	7	7	4366	4372	0 %	100 %	0 %	0 %	218847800
63	NC_011771	TGT	2	6	4429	4434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847800
64	NC_011771	AGC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218847800
65	NC_011771	ATA	2	6	4461	4466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847800
66	NC_011771	ATG	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847800
67	NC_011771	AAT	2	6	4663	4668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847800
68	NC_011771	AT	3	6	4733	4738	50 %	50 %	0 %	0 %	218847800
69	NC_011771	CTC	2	6	4740	4745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218847800
70	NC_011771	ATC	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847800
71	NC_011771	A	6	6	4851	4856	100 %	0 %	0 %	0 %	218847803
72	NC_011771	AT	3	6	4885	4890	50 %	50 %	0 %	0 %	218847803
73	NC_011771	A	6	6	4933	4938	100 %	0 %	0 %	0 %	218847803
74	NC_011771	ACCA	2	8	4977	4984	50 %	0 %	0 %	50 %	218847803
75	NC_011771	TCCTTC	2	12	5001	5012	0 %	50 %	0 %	50 %	218847803
76	NC_011771	TCA	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847803
77	NC_011771	AAT	2	6	5426	5431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847805
78	NC_011771	AAAAG	2	10	5473	5482	80 %	0 %	20 %	0 %	218847805
79	NC_011771	GT	3	6	5583	5588	0 %	50 %	50 %	0 %	218847805
80	NC_011771	ACA	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847805
81	NC_011771	ATA	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847805
82	NC_011771	TGA	2	6	5675	5680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847797
83	NC_011771	TTC	2	6	5760	5765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847797
84	NC_011771	A	9	9	5773	5781	100 %	0 %	0 %	0 %	218847797
85	NC_011771	AT	3	6	5820	5825	50 %	50 %	0 %	0 %	218847797
86	NC_011771	ATA	2	6	5831	5836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847797
87	NC_011771	AAT	2	6	5839	5844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847797
88	NC_011771	ATAA	2	8	6754	6761	75 %	25 %	0 %	0 %	218847806
89	NC_011771	T	6	6	6776	6781	0 %	100 %	0 %	0 %	218847806
90	NC_011771	CTT	2	6	6815	6820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847806
91	NC_011771	TAG	2	6	6832	6837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218847806
92	NC_011771	AAC	2	6	6862	6867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847806
93	NC_011771	CATT	2	8	6973	6980	25 %	50 %	0 %	25 %	218847806
94	NC_011771	CTGCAT	2	12	7039	7050	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218847806
95	NC_011771	CTT	2	6	7054	7059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847806
96	NC_011771	TA	3	6	7106	7111	50 %	50 %	0 %	0 %	218847806
97	NC_011771	ATCA	2	8	7121	7128	50 %	25 %	0 %	25 %	218847806
98	NC_011771	A	6	6	7128	7133	100 %	0 %	0 %	0 %	218847806
99	NC_011771	TAAT	2	8	7173	7180	50 %	50 %	0 %	0 %	218847806
100	NC_011771	T	6	6	7223	7228	0 %	100 %	0 %	0 %	218847806
101	NC_011771	TTC	2	6	7247	7252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847806
102	NC_011771	CCA	2	6	7254	7259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218847806
103	NC_011771	TCT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847806
104	NC_011771	TCTT	2	8	7358	7365	0 %	75 %	0 %	25 %	218847806
105	NC_011771	T	8	8	7370	7377	0 %	100 %	0 %	0 %	218847806
106	NC_011771	AAT	2	6	7394	7399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218847806
107	NC_011771	T	7	7	7627	7633	0 %	100 %	0 %	0 %	218847801
108	NC_011771	T	6	6	7671	7676	0 %	100 %	0 %	0 %	218847801
109	NC_011771	CT	4	8	7732	7739	0 %	50 %	0 %	50 %	218847801
110	NC_011771	T	6	6	7767	7772	0 %	100 %	0 %	0 %	218847801
111	NC_011771	T	7	7	7876	7882	0 %	100 %	0 %	0 %	218847801
112	NC_011771	TTTC	2	8	7901	7908	0 %	75 %	0 %	25 %	218847801
113	NC_011771	TC	3	6	7963	7968	0 %	50 %	0 %	50 %	218847801
114	NC_011771	CTT	2	6	8021	8026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847801
115	NC_011771	CTA	3	9	8108	8116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847801
116	NC_011771	CTT	2	6	8117	8122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847801
117	NC_011771	T	6	6	8204	8209	0 %	100 %	0 %	0 %	218847801
118	NC_011771	TTTTCA	2	12	8245	8256	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218847801
119	NC_011771	CT	3	6	8257	8262	0 %	50 %	0 %	50 %	218847801
120	NC_011771	CAA	2	6	8300	8305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218847801
121	NC_011771	GTTT	2	8	8343	8350	0 %	75 %	25 %	0 %	218847801
122	NC_011771	T	6	6	8362	8367	0 %	100 %	0 %	0 %	218847801
123	NC_011771	AT	3	6	8509	8514	50 %	50 %	0 %	0 %	218847801
124	NC_011771	TA	3	6	8532	8537	50 %	50 %	0 %	0 %	218847801
125	NC_011771	TC	3	6	8551	8556	0 %	50 %	0 %	50 %	218847801
126	NC_011771	TTC	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847801
127	NC_011771	TTG	3	9	8595	8603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218847801
128	NC_011771	ACT	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847801
129	NC_011771	TCA	2	6	8695	8700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847801
130	NC_011771	CTT	2	6	8771	8776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847801
131	NC_011771	GTC	2	6	8799	8804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218847801
132	NC_011771	ATC	2	6	8853	8858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218847801
133	NC_011771	CTT	2	6	8933	8938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218847801
134	NC_011771	TAT	2	6	9041	9046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218847801
135	NC_011771	GATT	2	8	9070	9077	25 %	50 %	25 %	0 %	218847801

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.